Identificación molecular de cepas ambientales aisladas en la costa Caribe colombiana

Resumen

La microbiota de la costa Caribe colombiana ha sido poco explorada, lo que limita el conocimiento sobre microorganismos de interés sanitario y biotecnológico presentes en sus ecosistemas. En este contexto, el presente trabajo integra resultados de cuatro proyectos donde integra aislamientos microbianos los cuales han sido desarrollados en el laboratorio CINBIOS de la Universidad Popular del Cesar, cuyo objetivo fue aislar y caracterizar microorganismos de interés sanitario y biotecnológico provenientes de diferentes ambientes de la costa Caribe colombiana. Se realizaron muestreos en la bahía de Santa Marta y zonas costeras aledañas, en el emisario submarino de esta ciudad y en jagüeyes destinados al consumo humano en zonas rurales de los municipios de Astrea (Cesar) y Uribia (La Guajira). Las muestras se recolectaron en recipientes estériles, se transportaron refrigeradas y se procesaron en un periodo máximo de 24 horas. El aislamiento se adaptó al tipo de muestra y al microorganismo objetivo mediante diluciones seriadas y siembra en medios de cultivo selectivos y diferenciales. Para bacterias se emplearon agar XLD, MacConkey y EMB, mientras que para hongos filamentosos y levaduras se utilizaron agar Sabouraud y Rosa de Bengala suplementados con cloranfenicol. Los aislamientos se caracterizaron mediante observación macroscópica y microscópica, tinción de Gram y azul de lactofenol, según el grupo microbiano. La identificación se realizó mediante espectrometría de masas MALDI-TOF, tecnología que permite obtener perfiles proteicos característicos y compararlos con bases de datos de referencia para apoyar la identificación microbiana. Entre los microorganismos identificados se encuentran Salmonella enterica subsp. enterica, Klebsiella pneumoniae, Escherichia hermannii y Candida tropicalis, de interés sanitario, así como Rhodotorula glutinis, de interés biotecnológico. Se destaca el aislamiento de S. enterica subsp. enterica en agua de jagüey destinada al consumo humano, hallazgo relevante desde la perspectiva de la vigilancia microbiológica y la salud pública rural. Asimismo, R. glutinis fue evaluada y caracterizada como productora de carotenoides, compuestos con potencial de aprovechamiento biotecnológico. Estos resultados parciales contribuyen al conocimiento de la diversidad microbiana de ambientes de la costa Caribe colombiana y resaltan la utilidad de herramientas de identificación basadas en perfiles proteicos para la caracterización de microorganismos de interés sanitario y biotecnológico. Además, constituyen una base para continuar las investigaciones orientadas a la evaluación de riesgos microbiológicos ambientales y al estudio del potencial biotecnológico de los aislamientos obtenidos.